Uma das incertezas significativas na MotoGP para 2025 é o futuro da Prima Pramac Racing, que pode continuar como a equipe satélite da Ducati ou mudar para a Yamaha. O futuro de Morbidelli pode depender dessa decisão.
De acordo com o GP-Inside.com, se a Pramac decidir unir forças com a Yamaha, espera-se que o piloto italiano se mude para a Pertamina Enduro VR46, continuando assim com uma moto Ducati em vez de retornar à YZR-M1 após suas dificuldades até 2023.
Ambos os pilotos atuais da equipe de Valentino Rossi, Fabio Di Giannantonio e Marco Bezzecchi, estão no final de seus contratos. Bezzecchi está fortemente ligado a uma mudança para a Aprilia. Portanto, Morbidelli substituiria seu compatriota e continuaria pilotando uma Desmosedici GP.
Após perder a pré-temporada devido a uma lesão sofrida no final de janeiro durante os treinos, Morbidelli tem mostrado competitividade com a moto da Borgo Panigale. Seus resultados têm melhorado gradualmente, sendo seu melhor resultado da temporada um sexto lugar no GP da Itália.