モト3イタリアGPのポールポジションを争う最後の4人のライダーが決定しました。スコット・オグデンはムジェロでの最初の予選セッションをリードし、デビッド・ムニョス、ジョエル・ケルソ、フィリッポ・ファリオリと共に進出しました。
最初のフライングラップの後、ニコラ・カラーロ（レベルアップ-MTA/KTM）がQ1をリードし、オグデン（MLav Racing/Honda）とジョエル・エステバン（CFMoto Valresa Aspar）が続き、Ángel・ピケラス（レオパード・レーシング/Honda）が4位にいました。
ほぼすべてのライダーがピットに戻ったため、数分間スタンディングはほとんど変わりませんでした。ムニョス（BOE Motorsports/KTM）は最初のラップが無効になったため、スタンディングの底にいました。
最後の3分間で、ムニョスはトップに浮上し、チームメイトのケルソが2位に上がりました。カラーロとオグデンはそれぞれ3位と4位に下がり、エステバンとピケラスはトップ4から外れました。
エステバンとピケラスは一時的にトップ4に再入りしましたが、最終的には他のライダーの改善によって追い越されました。オグデンはトップでフィニッシュし、ムニョスを0.378秒差で下しました。ケルソは3位、ファリオリ（SIC58スクアドラ・コルセ/Honda）が最後の瞬間に4位を奪いました。エステバンは5位で、0.243秒差で進出を逃しました。
結果:
