ハウメ・マシアはMoto3マレーシアGPのポールポジションを獲得しました。チャンピオンシップリーダーは、セパンで新しいラップレコードを設定し、最も近いライバルをほぼ1秒差で引き離して予選セッションを終了しました。
トラックに最初に出たライダーの中で、リーダーはホセ・アントニオ・ルエダ（レッドブルKTMアホ）で、ハビエル・アルティガス（CFMotoレーシング・プルステルGP）の前を走っていました。しかし、ほとんどのパックは初回のフライングラップを少し遅れて完了し、リーダーボードは完全に変わりました。現在のリーダーはコリン・ヴェイヤー（リキモリ・ハスクバーナ・インタクトGP）で、イバン・オルトラ（アンジェルスMTAチーム/KTM）が2位にいました。
4分前にマシア（レオパードレーシング/ホンダ）が1位に立ち、2分10秒の新しいラップレコードを記録したことで、順位に新たな革命が起こりました。ササキ・アユム（リキモリ・ハスクバーナ・インタクトGP）は、その直前に一時的に3位に達しましたが、最終的には4位に終わりました。
マシアを超える者は最後まで現れず、0.906秒差でポールポジションを確保し、ヴェイヤーが2位に入りました。マッテオ・ベルテッレ（リヴァコールド・スナイパーズチーム/ホンダ）は、終盤に一時的に3位を保持しましたが、オルトラが4位、ササキが5位に入りました。
Q2の結果：
全体の予選結果：
