ルカ・マリーニとエネア・バスティアニーニは、マンデリカで行われたMotoGPインドネシアGPの予選第一段階で最速のライダーとなり、ポールポジション争いの最後のスポットを確保しました。チャンピオンシップリーダーのフランチェスコ・バニャイアは、この機会を逃しました。
最初の計時ラップの後、マリーニ（ムーニーVR46レーシングチーム/ドゥカティ）とヨハン・ザルコ（プリマ・プラマック/ドゥカティ）が予選ポジションを保持し、バニャイア（ドゥカティ）はラップタイムが取り消されました。
ザルコはタイムを改善してリードを奪い、フランコ・モルビデリ（モンスターエナジー・ヤマハ）が二回目の試みで二位に入りました。バニャイアはわずか0.006秒差で三位となりました。
残り3分を切ると、ポジションが再び変わり、マリーニが一位に、バニャイアが二位に上がりましたが、チームメイトのバスティアニーニに抜かれました。
予選ポジションにさらなる変動はなく、マリーニとバスティアニーニがそのポジションを保持しました。バニャイアはQ2への進出を0.099秒差で逃し、13位からスタートします。ザルコは終盤にクラッシュし、モルビデリの前で14位に留まりました。
結果：
