アレックス・マルケスがMotoGPマレーシアグランプリのプラクティスをリードしました。スペインのライダーは最初から最も速いライダーの一人であり、ホルヘ・マルティンとともに1分57秒台でラップを刻み、トップの位置を確認しました。
最初のフライングラップの後、リードはマルク・マルケス（レプソルホンダ）が握り、弟のアレックス・マルケス（グレシーニ/ドゥカティ）にわずか44千分の1秒差で先行しました。2回目のアタックでは順位が逆転し、ヨハン・ザルコ（プライマ・プラマック/ドゥカティ）が3位となりましたが、後に同胞のファビオ・クアルタラロ（モンスターエナジー・ヤマハ）に抜かれました。最初の10分間で、アレイシ・エスパルガロ（アプリリア）が大きな影響なくクラッシュしました。
セッション開始から約20分後、新たなリーダーが現れました：マルティン（プライマ・プラマック/ドゥカティ）はアレックス・マルケスより0.182秒速かったです。数瞬前には、ミゲル・オリベイラ（クリプトデータRNF MotoGPチーム/アプリリア）がトップ5に入っており、後にマーベリック・ビニャーレス（アプリリア）も加わることになります。
チェッカーフラッグまで約15分の時点で、ザルコはマルティンにわずか7千分の1秒差まで改善し、クアルタラロは3位に上昇しました。しかし、ブラッド・ビンダー（レッドブルKTM）がこの段階で最速でした…短い間だけでしたが、その後クアルタラロが0.094秒速くなりました。諦めずに、南アフリカのライダーはすぐにリードを取り戻しました。一方、アレイシ・エスパルガロ（アプリリア）はこの日4回目の転倒を経験しました。
タイミングシートの状況は長続きせず、Álex Márquezがリードを取り戻しました。しかし、まだ多くの時間が残っており、最後の2分間でようやくベストラップが現れました。マルティンが最初に1分57秒台に突入しましたが、最終的にはÁlex Márquezが同国のライダーを0.174秒上回るペースを設定しました。
レッドブルKTMは好調で、ジャック・ミラーが3位、ブラッド・ビンダーが4位、ビニャーレスが5位でフィニッシュしました。チャンピオンシップリーダーのバニャイアは8位にとどまりましたが、第二予選フェーズへの直接出場権を確保しました。これを達成した最後のライダーはザルコで、モルビデリの84千分の1秒前に10位でフィニッシュしました。Q1に降格されたライダーには、レプソルホンダのマルク・マルケスとジョアン・ミル、そしてエネア・バスティアニーニ（ドゥカティ）やアレイシ・エスパルガロが含まれています。
