Por quinta vez esta temporada, Iván Ortolá saldrá desde la pole position en Moto3. El piloto fue el más rápido en la sesión de clasificación para el GP de Japón, estableciendo un nuevo récord de vuelta en Motegi con un tiempo de 1m54.761s.
Collin Veijer (Liqui Moly Husqvarna Intact GP) fue el primer líder de Q1, seguido por David Alonso (CFMOTO Gaviota Aspar), quien fue 0.304s más lento en las primeras vueltas. Joel Kelso (BOE Motorsports/KTM) ocupó el tercer lugar.
Ortolá (MT Helmets-MSi/KTM) fue el siguiente piloto en ascender a la cima de la clasificación, empujando a Veijer al segundo lugar por 0.387s, mientras que Alonso cayó al tercero y Ángel Piqueras (Leopard Racing/Honda) se mantuvo en cuarto.
En los últimos cinco minutos, Ryusei Yamanaka (MT Helmets-MSi/KTM) subió al tercer lugar y ocupó brevemente el segundo antes de que Veijer recuperara la posición. El holandés incluso logró tomar la delantera en el último minuto.
Sin embargo, Ortolá lo hizo aún mejor, convirtiéndose en el único piloto en dar una vuelta en 1m54s (1m54.761s) para asegurar la pole position, superando a Veijer por una clara diferencia de 0.356s. Alonso aseguró el tercer lugar, 0.409s detrás, mientras que su principal rival en el campeonato, Daniel Holgado (Red Bull GasGas Tech3), fue relegado al noveno.
Resultados:
