Diogo Moreira begann das Moto3 Japan GP als schnellster Fahrer in der ersten Trainingssitzung. Es war genau am Ende der Sitzung, dass der brasilianische Fahrer die Benchmark-Zeit des Morgens in Motegi setzte.
Nach ständigen Führungswechseln in den ersten 15 Minuten hielt Jaume Masiá (Leopard Racing/Honda den ersten Platz für etwa 13 Minuten, bis er von Ryusei Yamanaka (Gaviota GasGas Aspar) überholt wurde. Die letzten 15 Minuten waren erneut intensiv, mit viel Instabilität in der Zeitentabelle.
Am Ende fuhr Moreira (MT Helmets-MSi/KTM) – der kurzzeitig die Führung übernommen hatte – zwei schnelle Runden hintereinander, die ihn an die Spitze brachten. Seine beste Zeit betrug 1m57.260s, was ihm erlaubte, David Muñoz (BOE Motorsports/KTM) um 0.206s zu schlagen. Masiá belegte den dritten Platz. Weiter hinten im Feld belegte der andere Fahrer, der sich die Meisterschaftsführung teilt, Daniel Holgado (Red Bull KTM Tech3), den sechsten Platz.
Zeitentabelle: